康熙親征大漠

康熙二十九年（1690年），噶爾丹不聽康熙勸諭，帶領精騎20000自呼倫池南下，殺進內蒙，前鋒直抵距北京不到千里的烏珠沁部落。康熙皇帝一方面諭令噶爾丹罷兵息戰，歸還喀爾喀蒙古故地，同時也加強了口外兵力，準備武裝平叛。經派人調查和喀爾喀諸部的反映，他明白噶爾丹的崛起和對蒙諸部的殺戮吞併，嚴重地威脅着西北邊疆各族人民的生存與發展；其投靠沙俄、引狼入室也嚴重威脅中俄西段邊界的穩定和西北邊疆的主權。總之，噶爾丹不除，大清的江山社稷就永無寧日。所以，康熙皇帝否決了廷臣中王者不治夷狄對，噶爾丹所爲聽之任之的妥協傾向，毅然決定跨馬親征。
首戰·略有遺憾
康熙二十九年七月，清朝大軍兵分三路：第一路，撫遠大將軍裕親王福全與皇子胤率左翼軍出古北口；第二路，安北大將軍常寧率右翼軍出喜峯口迎擊叛軍；第三路，阿爾尼率部與盛京、吉林滿兵及科爾沁蒙兵出擊烏爾會河口，是爲側翼。計劃三路大軍會師烏珠穆沁草原，康熙自率親軍駐紮博洛河屯地，節制調度諸軍。左翼軍出師不利，噶爾丹乘勝渡過西拉木倫河，進佔烏蘭布通（今遼寧省照烏達盟克什克騰旗南境，距北京350公里）。康熙皇帝當機立斷，將右翼軍改由康親王傑書統率，令其駐守歸化，截住噶爾丹退路。八月初，常寧會阿爾尼清軍將噶爾丹包圍在烏蘭布通與之決戰。噶爾丹依山面水佈下駝城（即將駱駝縛蹄臥地，駝背堆放箱垛，上蒙溼布，叛軍士卒可在垛隙向外施放弩矢火銃），滿以爲駝城易守難攻，堅不可摧，清軍隔河列陣，火銃齊發，大炮怒吼，自午後至日暮，猛烈的炮火摧毀了駝城，死傷的駱駝反而成爲叛軍奔逃的障礙，清軍大隊精騎掩殺而進，叛軍橫屍遍野，潰散鼠竄。噶爾丹帶領殘兵敗將，在夜幕掩護下突出重圍，第二天一早派人向清軍陣前求和乞降，但不等回報即爬越大磧山北遁，所過皆燒荒以絕追騎。康熙不許噶爾丹乞和之請，諭令進兵圍追堵截殘敵，而昏庸懦弱的福全未接到諭令，竟擅自同意叛軍之請，撤回軍隊，放出噶爾丹北逃歸路。當他接到康熙進擊手令時已是噶爾丹逸竄之後的第6天，派出的追兵一路馬無草食，腳力不濟，無功而返，錯過全殲殘敵之機。時康熙身染重病，不能繼續駐蹕風沙怒號的塞外繼續指揮戰爭，只得班師回朝。對此，他痛心疾首，聲淚俱下地說：“朕此次親征，原欲剿滅叛逆，以靖邊陲，不料身染沉痾，未能消滅此賊，實在可恨！”但是，玄燁不愧爲一國之君，他不是激化矛盾，而是控制自己的感情，理智地處理了善後事宜。當有人奏劾裕親王福全不乘勝追剿殘敵，竟擅自議和，且檄止常寧進兵，致敵逸竄，康熙以福全率大軍有烏蘭布通之役，功過相抵，僅薄罰其俸，不再問追；又有人舉報科爾沁土謝圖親王通敵，玄燁爲穩定內外蒙古部落，也不予追查；他又重賞常寧以下奮勇殺敵的將官兵卒，最終以結束了善後工作。接着，敕諭噶爾丹不得再興兵犯亂，然後徐徐班師。